有些人把保健食品當作藥，認為飯後吃比較不傷胃；有些人則認為空腹吃，吸收效果比較好。到底哪一種說法比較正確呢？首先，要澄清的是，保健食品是「食品」、不是「藥品」，不能用於治病，依法也不能宣稱療效。至於什麼時候吃的吸收效果較好？一般來說，水溶性保健食品建議飯前食用，脂溶性保健食品建議飯後食用，但因各家廠牌建議使用量和方式不相同，民眾還是依外包裝食品標示建議使用較妥當。

水溶性維生素：維生素B群、維生素C屬於水溶性維生素，不論飯前、飯後服用都不會影響其作用，但仍建議飯前食用，可幫助吸收。

脂溶性維生素：維生素A、D、E、K及Omega-3脂肪酸魚油等營養素屬於脂溶性維生素，會溶解在脂肪中被腸道所吸收。因此，建議於用餐後補充。
鈣：建議避免與高草酸食物一起食用，像是巧克力、菠菜等食物，避免影響吸收率，平常若是想補充鈣質建議可飯前食用；另外鈣質也含有放鬆肌肉、安定神經作用，想要幫助睡眠者建議可睡前1小時食用。